拒絕與本地運動會合作，卻忙著聯手日本東京奧運會舉辦展覽，臺北故宮博物院此舉在島內引發批評。

第29屆夏季世界大學生運動會將于8月在臺北舉辦，島內認為這是傳播臺灣文化觀光的好機會。據聯合新聞網14日報道，“立委”吳思瑤在臉書稱，臺北市政府曾向臺北故宮提出許多合作計劃，包括選手門票優惠、開發周邊商品等，但頻頻遭到拒絕。而2020年東京奧運會的待遇大不相同，臺北故宮正積極與日本洽談合作，希望把典藏品送到日本展覽。吳思瑤稱，將有1.2萬名世界各地選手來臺參加比賽，推廣臺北故宮展覽與文物可吸引游客來臺觀光，其實也是故宮的本業，“不懂得近水樓臺先得月，反而國外的月亮比較圓”，根本是本末倒置，“充分暴露故宮自我的本位主義”。

臺北故宮博物院院長林正儀回應稱，他不知道跟大運會合作的詳細情形，會再跟臺北故宮的策展小組討論，絕對不會將臺灣擺在最后。雖然大運會距開幕只剩5個月，但臺北故宮會再全力與臺北市溝通，看看能提供什么協助。臺灣“中央社”稱，2014年臺北故宮曾在東京、九州舉辦“神品至寶展”，當時在東京就有80萬人次參觀。2020年，臺北故宮計劃再和東京、九州博物館聯合策劃展覽，預計可能展出日方希望看到的北宋畫家郭熙的《早春圖》。

臺北故宮近來爭議不斷，前幾日因畫展改名一事被指“去中國化”，游客日漸減少也是巨大的挑戰，2016年的總參訪人數較前一年少了60萬人。

此外，故宮南院的訪客也不理想。“中時電子報”稱，南院5日落幕的“日本美術之最”特展，3個月只吸引了10萬人次，平均每天只有1000人參觀，與20萬訪客的預期落差很大。臺北故宮如果對中華文化的認同無法定位，也就難以避免南院難聚人氣而淪為“蚊子館”的命運。